mRNA, ökaryotik hücrelerde hücre çekirdeği içinde, prokaryotik hücrelerde ise sitoplazmada sentezlenir.
Ökaryotik Hücreler:
mRNA sentezi (transkripsiyon) hücre çekirdeği içinde gerçekleşir. DNA'daki genetik bilgi, RNA polimeraz enzimi aracılığıyla mRNA'ya aktarılır. Oluşan ön-mRNA (pre-mRNA), daha sonra işlenerek (splicing, capping, poliadenilasyon) olgun mRNA'ya dönüştürülür. Olgun mRNA, çekirdek zarındaki porlardan geçerek sitoplazmaya taşınır.
Prokaryotik Hücreler:
mRNA sentezi ve translasyon (protein sentezi) aynı anda sitoplazmada gerçekleşir. Prokaryotlarda çekirdek zarı bulunmadığından, mRNA'nın işlenmesi gibi bir süreç de yoktur.